مهدی دقیقی شاهرودی از سن14سالگی مطالعات عمیق دینی خود را آغاز نمود و در سن۱۶سالگی در حالی که در دبیرستان مشغول به تحصیل بود پس از قبولی در آزمون ورودی حوزه علمیه قم به صورت طلبه رسمی به شهر قم مهاجرت کردو تحصیلات خودرا در محضر مدرسان بزرگ علوم دین آغاز نمود. وی صرف و نحو(اساتید: واعظ موسوی/ حسینی قمی)، بلاغت معانی وبیان(اساتید:موحدی)، منطق و معقولات(اساتید:واعظ موسوی/حسن ثقفی تهرانی/فیاضی/ انصاری شیرازی/ممدوحی)، عقاید و کلام(جعفر سبحانی/ مصباح یزدی/علی ربانی گلپایگانی)، ادبیات فارسی(کوهی/ثقفی)، فقه واصول(اساتید:مقیسه/علی دوست ابرقویی/شمس الدین واعظی/میرزا جواد تبریزی/ سید رسول تهرانی / موسی شبیری زنجانی/وحید خراسانی)،تاریخ وادیان (اساتید:سید مهدی خرسان / جعفر سبحانی/مهدی پیشوایی) مبانی عرفان واخلاق (یحیی انصاری شیرازی) علوم قرآن وتفسیر(اساتید:جوادی آملی/ محمدهادی معرفت) و دیگرعلوم مختلف دینی را از محضر مدرسان فرهیخته حوزه فرا گرفت.

 او پس از چندسال کسب علوم مختلف از علماو دانشمندان حوزه خود به تحقیق و تحصیل پیرامون معارف دین پرداخت و برای یافتن راه صحیح سلوک دینی تحقیقات خود را آغاز نمود و گوهر گمشده وجودخود را در حوزه نجف اشرف و سرآمدان آن حوزه کهن یافت و از این رو برای شناخت ابعاد بیشتر ریشه های علم و عالمان آن سامان به مسافرتهای مکرربه آن دیار پاک و تحقیقات گسترده درباره آن حوزه کهن همت گمارد. نتیجه تحصیلات و تحقیقات دینی و تلاشهای علمی وی در حوزه معارف دین ارتباط تنگاتنگ با مجتهدین و عالمان فرهیخته حوزه و کسب اجازات مختلف از آن بزرگواران بود. وی در خلال مطالعات دینی تحصیلات کلاسیک خود را نیز ادامه داد و مقاطع کارشناسی (قرآن وحدیث)، ارشد (تاریخ تشیع) و دکتری تخصصیPhD(تاریخ اسلام ) را نیز طی نمود . اما محصور شدن در نظام آموزشی حوزه ودانشگاه مطلوب او نبود و تحقیقات آزادانه و همراه با حریت در حوزه مسائل دین رابرای خود برگزید که حاصل آن چندین سال تدریس، تحقیق و تبلیغ در حیطه مباحث دینی می باشد. 

دغدغه همیشگی ایشان عدم استفاده از علوم فراگرفته توسط علما وفرهیختگان و جاری نشدن علوم دینی ومعارف راه گشای الهی در سطح جامعه بود، او معتقد است اگر فردی علوم را کسب نماید اما آن را به دیگران نیاموزد ودیگران نیز از علوم او استفاده نکنند آن فرد عالم نیست و با جاهل تفاوتی ندارد. و از سوی دیگر عدم حضور دانش آموختگان حوزه در جامعه زمینه ورود دزدان اعتقادات را فراهم می آورد. از این رو در خلال تحصیل از قم به مناطق مختلف از جمله زادگاه خود تهران سفر می نمود و در حلقه های مختلف درس و گفتگوی دینی با جوانان، نوجوانان ودانشجویان به انتقال یافته های خود می پرداخت.

وی نشر فضایل و علوم اهل بیت علیهم السلام، پاسخگویی به مسائل شرعی، شرکت در مناظرات دینی، مسافرتهای تبلیغی، تاسیس واداره سایتهای اینترنتی دینی، تدریس در دانشگاه وحوزه، نوشتن و تهیه مقالات مورد نیازجامعه، رفع اختلافات عموم طبقات وترویج یکپارچگی، سخنرانی وبرگزاری مراسم ومناسک دینی واجتماعی ، مقابله جدی با منحرفان و شبهه افکنان و .... را ازجمله وظایف خود می داند .

مقالات مختلف در مجلات تخصصی پیرامون مسئله های نوظهور ونیازهای روز علمی وتاریخی و همچنین نگارش کتب تخصصی پیرامون مسائل ریشه ای وساختار محور حاصل دغدغه های دانشی ایشان است که با هدف شناخت معارف از ریشه تدوین ودر اختیار جامعه علمی قرار گرفت.